подсчитать количество таксономий в скрипте

Я решил это, логически упростив свой код, сделав еще две большие функции изображения. Затем вызов этих функций в мою большую функцию.

$(document).ready(function() {
$(".store_checkbox").change(function () {
    $('div[store_id=' + this.value + ']').toggle(this.checked);
    show_no_store_message();
}).change();
show_no_store_message();
});

function show_no_store_message() {
if (!is_store_selected()) {
    $("#hidden_taxon_message").show(); // none are checked
    $("#hidden_taxon_message").text('Please select store before selecting taxonomies');
} else if (is_store_selected()  && !do_any_stores_have_taxonomies() ) {
    $("#hidden_taxon_message").show(); // none are checked
    $("#hidden_taxon_message").text('None of the stores you selected have taxonomies');

} else {
    $("#hidden_taxon_message").hide(); // something is selected
}
}

// returns true if any store is selected
function is_store_selected(){
return ($('.store_checkbox:checked').length > 0);
}

// Returns true if any store selected AND store has taxonomiess
function do_any_stores_have_taxonomies(){
$('.store_checkbox:checked').each(function() {
    if ($(this).attr("taxonomies_count") > 0) {
     return true;   
    }
});
return false;
}

Это сделает то, что вы просили...

function show_no_taxonomies() {
    var taxonomiesCount = false;
    $('.store_checkbox:checked').each(function() {
        if ($(this).attr("taxonomies_count") > 0) {
            taxonomiesCount = true;
            return;
        }
    });
    if (!taxonomiesCount){
        $("#hidden_taxon_message").show();
        $("#hidden_taxon_message").text('This store does not have any taxonomies');
    }else {
        $("#hidden_taxon_message").hide(); // something is selected
    }
}

Однако я бы рекомендовал использовать атрибут data, а не специальный атрибут. Как это...

<input id="idea_store_ids_" class="store_checkbox" type="checkbox" value="124" data-taxonomies-count="0" name="idea[store_ids][]" />

и скрипт будет...

function show_no_taxonomies() {
    var taxonomiesCount = false;
    $('.store_checkbox:checked').each(function() {
        if ($(this).data("taxonomies-count") > 0) {
            taxonomiesCount = true;
            return;
        }
    });
    if (!taxonomiesCount){
        $("#hidden_taxon_message").show();
        $("#hidden_taxon_message").text('This store does not have any taxonomies');
    }else {
        $("#hidden_taxon_message").hide(); // something is selected
    }
}