PHP Merge Images

Добавьте ниже строки в свой код, ваша проблема должна быть решена,

imagealphablending($new_image, false);
imagesavealpha($new_image, true);
$transparent = imagecolorallocatealpha($new_image, 255, 255, 255, 127);
imagefilledrectangle($new_image, 0, 0, $width, $height, $transparent);

Только для вашей справки, полный исходный код для изменения размера изображения,

function resize($width,$height) {
      $new_image = imagecreatetruecolor($width, $height);
      if ($this->image_type == IMAGETYPE_PNG){
        imagealphablending($new_image, false);
        imagesavealpha($new_image, true);
        $transparent = imagecolorallocatealpha($new_image, 255, 255, 255, 127);
        imagefilledrectangle($new_image, 0, 0, $width, $height, $transparent);
      }
      imagecopyresampled($new_image, $this->image, 0, 0, 0, 0, $width, $height, $this->getWidth(), $this->getHeight());
      $this->image = $new_image;
   }