Rscript ведет себя по-разному при запуске из командной строки и из PHP Exec

Question

Rscript ведет себя по-разному при запуске из командной строки и из PHP Exec

0

Привет Я запускаю Rscript с PHP exec, и он ведет себя странно....... Он запускает R, но выдает ошибку в следующей строке:

filein = filein[,c("id","bank","trans_date","description","description_2",
                 "description_3","description_4","description_5" ,"type",
                 "debit","credit","statement_balance", "cleared_balance",
                 "debit_int_rate","credit_int_rate","category")]

Это простое перераспределение столбцов в наборе данных.

Это вызывает следующую ошибку:

Ошибка в

[.data.frame'(filein, , c("id", "bank", "trans_date", "description", 
:  undefined columns selected

Однако я запускаю тот же скрипт из командной строки, что он запускается без какой-либо ошибки.

(Я запускаю Rscript на машине ubuntu 14.04 с PHP5...... также, когда я запускаю тот же скрипт на Windows-машине с PHP, он также отлично работает)

У кого-нибудь есть идеи, почему это так?

user2987739 12 фев. 2015, в 11:31

Источник

0

Вы уверены, что символ "_" не каким-то образом читается при импорте кадра данных с использованием PHP5? - проверить, как названы столбцы, добавив «print colnames (filein)». Я думаю, что это может быть проблема синтаксического анализа текста, которая изменяет имя столбцов.
selenocysteine 12 фев. 2015, в 09:59
0

PHP работает с другими правами, чем Rscript, поэтому он может не иметь доступа к файлу.
LauriK 12 фев. 2015, в 10:21
0

@LauriK Точнее говоря, веб-сервер работает с другими правами, чем пользователь (другими словами, если PHP-скрипт вручную запускается пользователем на консоли, php будет работать с теми же правами, что и Rscript ). Но суть та же.
Konrad Rudolph 12 фев. 2015, в 10:27
0

@KonradRudolph Спасибо! Моя карьера системного администратора длилась всего два месяца, поэтому у меня есть некоторые базовые знания и я могу отлаживать проблемы с разрешениями и зависимостями, но я далек от систематического понимания.
LauriK 12 фев. 2015, в 10:32
1

Согласитесь, это скорее всего проблема с правами доступа к файлам. Попробуйте добавить проверку, когда вы читаете в файле, чтобы увидеть, читает ли он что-нибудь ... if (nrow (dataframe) == 0) stop ("dataframe не читается правильно")
cory 12 фев. 2015, в 13:30
0

Спасибо за всю вашу помощь .... Так что это не было проблемой с разрешениями ....... проблема была: ---- команда запускалась из php exec (Rscript Myfile.r " localhost / categoryorization / public / 1423746975.json ") Однако аргумент, который был получен R, был" localhost / categoryorization / public / 1423746975.json2 "По какой-то причине комбинация ubuntu / php добавила 2 в конец строки аргумента .... когда Я раздели 2 в сценарии R, он работал правильно
user2987739 12 фев. 2015, в 15:00

Показать ещё 4 комментария

Теги:

php

ubuntu

r

rscript

1 ответ

Ещё вопросы

Вы уверены, что символ "_" не каким-то образом читается при импорте кадра данных с использованием PHP5? - проверить, как названы столбцы, добавив «print colnames (filein)». Я думаю, что это может быть проблема синтаксического анализа текста, которая изменяет имя столбцов.
PHP работает с другими правами, чем Rscript, поэтому он может не иметь доступа к файлу.
@LauriK Точнее говоря, веб-сервер работает с другими правами, чем пользователь (другими словами, если PHP-скрипт вручную запускается пользователем на консоли, php будет работать с теми же правами, что и Rscript ). Но суть та же.
@KonradRudolph Спасибо! Моя карьера системного администратора длилась всего два месяца, поэтому у меня есть некоторые базовые знания и я могу отлаживать проблемы с разрешениями и зависимостями, но я далек от систематического понимания.
Согласитесь, это скорее всего проблема с правами доступа к файлам. Попробуйте добавить проверку, когда вы читаете в файле, чтобы увидеть, читает ли он что-нибудь ... if (nrow (dataframe) == 0) stop ("dataframe не читается правильно")
Спасибо за всю вашу помощь .... Так что это не было проблемой с разрешениями ....... проблема была: ---- команда запускалась из php exec (Rscript Myfile.r " localhost / categoryorization / public / 1423746975.json ") Однако аргумент, который был получен R, был" localhost / categoryorization / public / 1423746975.json2 "По какой-то причине комбинация ubuntu / php добавила 2 в конец строки аргумента .... когда Я раздели 2 в сценарии R, он работал правильно

user2987739 · Answer 1 · 2015-02-12T12-37-00.000Z

Спасибо за всю вашу помощь... Так что это не проблема с разрешениями (я исправил их ранее)....... проблема была: команда ----The, переданная в командную строку PHP exec, была sudo/Rscript/home/xin/Documents/ClassificationApp/ClassificationAllInOne.R " http://localhost/categorisation/public/classification/data/1423746975.json "

Однако аргумент, полученный R, был "localhost/category/public/1423746975.json2";

По какой-то причине комбинация Ubuntu/PHP добавила 2 к концу строки аргументов.... Я добавил строку в ClassificationAllInOne.R, чтобы удалить 2, и она отлично работала