C / C ++ Лучший способ написать это?

Используйте структуру.

int one;
int two[10];
char three;
typedef struct {
    int one;
    int two[10];
    char three;
} State;

...

State *state = new State; // C++ish
State *state = malloc(sizeof(State));  //Cish

...

void do_save(State* state) {
    state->one = &one;
    memcpy(state->two, &two, sizeof(state->two));
    state->three = three;
}

Есть много вещей, которые вы можете сделать легко, когда у вас есть структура. Например, вы можете сохранить свое текущее состояние и сохраненное состояние отдельно, а сохранение/восстановление может быть выполнено с помощью знака равенства. Запись в двоичный файл легко с fread/fwrite. Вы можете поместить свою структуру состояния в кучу или в стек, в зависимости от ваших потребностей.

#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>

typedef struct {
    int one;
    int two[10];
    char three;
} State;

void print_state(State* state) {
    printf("%i ",   state->one);
    int i;
    for (i = 0; i < 10; ++i) {
        printf("%i ",   state->two[i]);
    }
    printf("%c\n",  state->three);
}

int main() {
    State* state = (State*)(malloc(sizeof(State)));
    State current_state;
    FILE* input = fopen("binary.data", "rb");
    if (input) {
        fread(&current_state, sizeof(State), 1, input);
        fclose(input);
    }

    print_state(&current_state);

    current_state.one = 1;
    int i;
    for (i = 0; i < 10; ++i) {
        current_state.two[i] = i + 1;
    }
    current_state.three = 'Z';
    *state = current_state;

    FILE* output = fopen("binary.data", "wb");
    fwrite(state, sizeof(State), 1, output);
    fclose(output);
        free(state);
}