Тот же продукт, но добавляет еще одну строку в таблицу (только Javascript)

Во-первых, вы пытаетесь хранить свои товары и товары в ОДНОМ МАССИВЕ. Тележка должна содержать экземпляры продукта, а не наоборот.

Во-вторых, вы постоянно добавляете в таблицу html, не отнимая предыдущую строку (для того же продукта).

В-третьих, вы переводите свою переменную цены в Integer, денежные значения всегда должны быть float или double.

Я предполагаю, что вы ищете что-то вроде следующего:

var products = [];
        var cart = [];

        function addProduct() {
            var productID = document.getElementById("productID").value;
            var product_desc = document.getElementById("product_desc").value;
            var qty = document.getElementById("quantity").value;
            var price = document.getElementById("price").value;

            var newProduct = {
                product_id: null,
                product_desc: null,
                product_qty: 0,
                product_price: 0.00,
            };
            newProduct.product_id = productID;
            newProduct.product_desc = product_desc;
            newProduct.product_qty = qty;
            newProduct.product_price = price;


            products.push(newProduct);


            var html = "<table border='1|1' >";
            html += "<td>Product ID</td>";
            html += "<td>Product Description</td>";
            html += "<td>Quantity</td>";
            html += "<td>Price</td>";
            html += "<td>Action</td>";
            for (var i = 0; i < products.length; i++) {
                html += "<tr>";
                html += "<td>" + products[i].product_id + "</td>";
                html += "<td>" + products[i].product_desc + "</td>";
                html += "<td>" + products[i].product_qty + "</td>";
                html += "<td>" + products[i].product_price + "</td>";
                html += "<td><button type='submit' onClick='deleteProduct(\"" + products[i].product_id + "\", this);'/>Delete Item</button> &nbsp <button type='submit' onClick='addCart(\"" + products[i].product_id + "\", this);'/>Add to Cart</button></td>";
                html += "</tr>";
            }
            html += "</table>";
            document.getElementById("demo").innerHTML = html;

            document.getElementById("resetbtn").click()
        }
        function deleteProduct(product_id, e) {
            e.parentNode.parentNode.parentNode.removeChild(e.parentNode.parentNode);
            for (var i = 0; i < products.length; i++) {
                if (products[i].product_id == product_id) {
                    // DO NOT CHANGE THE 1 HERE
                    products.splice(i, 1);
                }
            }
        }

        function addCart(product_id) {


            //Indentify the product and add it to new "cart" array
            for (var i = 0; i < products.length; i++) {
                if (products[i].product_id == product_id) {
                    var cartItem = null;
                    for (var k = 0; k < cart.length; k++) {
                        if (cart[k].product.product_id == products[i].product_id) {//Already exists in cart, increment quantity.
                            cartItem = cart[k];
                            cart[k].product_qty++;//Increment by one only, as requested.
                            break;
                        }
                    }
                    if (cartItem == null) {
                        //Every item in the cart specifies the product in question as well as how many of the product there is in the cart, starts off at product quantity
                        var cartItem = {
                            product: products[i],
                            product_qty: products[i].product_qty // Start of at product quantity
                        };
                        cart.push(cartItem);
                    }

                    break
                }
            }

            renderCartTable();

        }

        function renderCartTable() {
            var html = '';
            var ele = document.getElementById("demo2");
            ele.innerHTML = ''; //Start by clearng your table of old elements

            html += "<table id='tblCart' border='1|1'>";
            html += "<tr><td>Product ID</td>";
            html += "<td>Product Description</td>";
            html += "<td>Quantity</td>";
            html += "<td>Price</td>";
            html += "<td>Total</td>";
            html += "<td>Action</td></tr>";
            for (var i = 0; i < cart.length; i++) {
                html += "<tr>";
                html += "<td>" + cart[i].product.product_id + "</td>";
                html += "<td>" + cart[i].product.product_desc + "</td>";
                html += "<td>" + cart[i].product_qty + "</td>";
                html += "<td>" + cart[i].product.product_price + "</td>";
                html += "<td>" + parseFloat(cart[i].product.product_price) * parseInt(cart[i].product_qty) + "</td>";
                html += "<td><button type='submit' onClick='subtractQuantity(\"" + cart[i].product.product_id + "\", this);'/>Subtract Quantity</button></td>";
                html += "</tr>";
            }
            html += "</table>";
            ele.innerHTML = html;
        }

        function subtractQuantity(product_id)
        {
            alert("Removing 1 instance of product "+product_id);
            for (var i = 0; i < cart.length; i++) {
                if (cart[i].product.product_id == product_id) {
                    cart[i].product_qty--;//decrement by one
                }

                if (cart[i].product_qty == 0) {
                    cart.splice(i,1);//Remove from cart
                }
                console.log("Products " + JSON.stringify(products));
            }
            //Finally, re-render the cart table
            renderCartTable();
        }

        function removeItem(product_id) {
            for (var i = 0; i < products.length; i++) {
                if (products[i].product_id == product_id) {
                    // DO NOT CHANGE THE 1 HERE
                    products.splice(i, 1);
                }
            }
        }

Это начнется с вашей корзины на количество, указанное в продукте, а затем увеличится/уменьшится на один.