Обмен двух элементов в Doctrine ArrayColection

У меня есть документ "Операция" в проекте symfony2, который содержит встроенную коллекцию других документов "Команды". Я пытаюсь написать действие, которое меняет положение двух команд. Я пытался рассматривать коллекцию как обычный PHP-массив, но поведение было не таким, как ожидалось.

class Operation
{
    ...
    /**
     * The sequence of commands
     * @MongoDB\EmbedMany(targetDocument="Command")
     */
    protected $commands;

    public function __construct()
    {
        $this->commands  = new \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection();
        $this->fallbacks = new \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection();
    }

    /**
     *
     */
    public function swapCommands($index1, $index2)
    {
        $temp = $this->commands[$index1];
        $this->commands[$index1] = $this->commands[$index2];
        $this->commands[$index2] = $temp;
    }
    ...
}

Когда я swapCommands(), затронутые элементы попадают в нижнюю часть массива. Например, скажем, у меня есть команды ['cd', 'ls', touch', 'mv']. Если я попытаюсь поменять индексы 0 и 1, я получаю [touch', 'mv', 'ls', 'cd']. Как я могу поменять два элемента в массиве? Моим последним прибегнуть к ручному перемещению коллекции и add() каждого элемента...