magento не может войти в админку

Итак, для вашей информации ngnix не разбирает htaccess вообще, и Magento сильно полагается на htaccess для обеспечения безопасности.

Прежде чем рассматривать вашу проблему, пожалуйста, знайте, что если у вашего сервера есть что-то другое, кроме локального доступа, вы рискуете, потому что, как вы можете видеть в файле app/etc/local.xml, доступном для всех, вы даете мир доступ к вашей базе данных.

Пожалуйста, ознакомьтесь с полным документом: http://info.magento.com/rs/magentocommerce/images/MagentoECG-PoweringMagentowithNgnixandPHP-FPM.pdf, где вы можете найти базовую конфигурацию ngnix для Magento:

server {
    listen 80 default;
    server_name magento.lan www.magento.lan; # like ServerName in Apache
    root /var/www/magento; # document root, path to directory with files
    index index.html index.php;
    autoindex off; # we dont want users to see files in directories
   location ~ (^/(app/\|includes/\|lib/\|/pkginfo/\|var/\|report/config.
xml)\|/\.svn/\|/\.git/\|/.hta.+) {
    deny all; #ensure sensitive files are not accessible
 }
location / {
    try_files $uri $uri/ /index.php?$args; # make index.php handle requests for
/
    access_log off; # do not log access to static files
    expires max; # cache static files aggressively
 }
location \~\* \.(jpeg\|jpg\|gif\|png\|css\|js\|ico\|swf)$ {
    try_files $uri $uri/ @proxy; # look for static files in root directory and
   ask backend if not successful
    expires max;
    access_log off;
 }
location @proxy {
    fastcgi_pass fpm_backend; # proxy everything from this location to backend
 }
location \~\.php$ {
    try_files $uri =404; # if reference to php executable is invalid return 404
    expires off; # no need to cache php executable files
    fastcgi_read_timeout 600;
    fastcgi_pass fpm_backend; # proxy all requests for dynamic content to
    # backend configured in upstream.conf
    fastcgi_keep_conn on; # use persistent connects to backend
    include fastcgi_params;
    fastcgi_param SCRIPT_FILENAME $document_root${fastcgi_script_name};
    fastcgi_param MAGE_RUN_CODE default; # Store code is defined in
   #administration > Configuration > Manage Stores
    fastcgi_param MAGE_RUN_TYPE store;
   } 
}

Затем, когда и только тогда, когда у вас есть доступ, запрещенный к файлу app/etc/local.xml, подумайте над добавлением тега ngnix к вашему вопросу, тогда пользователь с большим количеством знаний ngnix может помочь вам дальше меня (поскольку это больше работа с системным администратором, чем "кодер", вроде меня.

Все, что я могу сказать: похоже, если вы добавите fastcgi_param PHP_VALUE "session.auto_start=0"; по разделу

location \~\.php$ {
    fastcgi_param PHP_VALUE "session.auto_start=0"; 
    #... more come here but I'm shortening just for the specific problem
}

Это должно делать свое дело.