Я читаю файл и подсчитываю количество аминокислот во всем файле fasta. Пока что все работает хорошо. Затем мне нужно рассчитать проценты и вывести пять старших, с сокращением аминокислот, подсчетом и процентами. У меня есть все элементы, но после этого возникают проблемы. У меня есть два словаря, одинаковые ключи в обоих с разными значениями (подсчет и процент). Я пытался объединить два словаря в один список, но изо всех сил.

counts = {}

#open file, read line at a time
for line in open('e_coli_k12_dh10b.faa', 'r'):
line = line.rstrip()    
#ignore header line
if line.startswith('>'):continue
for aa in line:
    #if key in dict, add 1
    if aa in counts:
        counts[aa] += 1           
    #else, (if empty) for aa, set to 1
    else:
        counts.update({aa:1})

#get sum of all dictionary values
total = sum(counts[item] for item in counts)

#iterate over values, add to dictionary divided by total * 100
#new dict for percentages
centages = {}

for aa, tally in counts.items():
    #maths for percentages
    percent = (1. * tally / total * 100)  

#within for loop, add aa and percent to centages    
centages.update({aa: percent})


print(counts.keys())
print(counts.values())
print(centages.keys())
print(centages.values())

рассчитывает словарь

['A', 'C', 'E', 'D', 'G', 'F', 'I', 'H', 'K', 'M', 'L', 'N', 'Q', 'P', 'S', 'R', 'U', 'T', 'W', 'V', 'Y', 'X']

[123885, 14983, 74992, 66618, 95475, 50554, 77836, 29255, 57151, 36759, 139002, 50492, 57732, 57595, 74803, 71819, 3, 69645, 20019, 91683, 36836, 1]

словарь сантиментов

['A', 'C', 'E', 'D', 'G', 'F', 'I', 'H', 'K', 'M', 'L', 'N', 'Q', 'P', 'S', 'R', 'U', 'T', 'W', 'V', 'Y', 'X']

[9.550641489186193, 1.1550814177057491, 5.781343234104621, 5.1357681295282385, 7.360435050087193, 3.8973493953611724, 6.000595156413581, 2.2553498548342583, 4.405930594894298, 2.8338542236832165, 10.71605334204996, 3.8925696417805975, 4.450721511512268, 4.44015979795519, 5.766772694963835, 5.5367277806987385, 0.0002312783990600846, 5.369128034179864, 1.5433207569279443, 7.068099153675245, 2.839790369259092, 7.709279968669486e-05]

Вот где я застрял - у меня есть первые элементы словаря в списке, но мне нужно добавить centages.values в соответствующее место. Я пытался это:

    #for loop to set aa to list as keys - [counts.keys, 
counts.values, centages.values]
L = []
for aa, tally in counts.items():
    L.append([aa, tally])

#add centages.values to list L at aa
for i in range(len(counts)):
    for aa, percent in centages.items():
        if(L[i] == centages.keys):
            L[i].append(centages.values)

print(L)    #just aa, tally so far

Токовый выход:

[['A', 123885], ['C', 14983], ['E', 74992], ['D', 66618], ['G', 95475], ['F', 50554], ['I', 77836], ['H', 29255], ['K', 57151], ['M', 36759], ['L', 139002], ['N', 50492], ['Q', 57732], ['P', 57595], ['S', 74803], ['R', 71819], ['U', 3], ['T', 69645], ['W', 20019], ['V', 91683], ['Y', 36836], ['X', 1]]

Итак, последний элемент, который мне нужно добавить, это не добавление. Я уверен, что это что-то простое.

Ожидаемый результат должен быть: ['A', 123885, 9.55], [etc]