Как визуализировать матрицу корреляции в виде схемы в Matlab

Я закончил и отправил мою версию в FEX: schemaball и обновит ссылку как можно скорее.

Есть некоторые отличия от вклада Gunther Struyf:

• Вы можете вернуть дескрипторы графическому объекту для полной ручной настройки
• Ярлыки ориентированы так, чтобы обеспечить максимальную читаемость слева направо.
• Рисунок растягивается, чтобы вставлять метки, оставляя оси без изменений
• Синтаксис требует только матрицы корреляций (но допускает дополнительные входы)
• Оптимизирован для производительности.

Следуйте примерам демонстрационных, пользовательских ярлыков и настроек объявлений. Примечание: первая цифра экспортировалась с saveas(), все остальные с export_fig.

schemaball

x      = rand(10).^3;
x(:,3) = 1.3*mean(x,2);
schemaball(x, {'Hi','how','is','your','day?', 'Do','you','like','schemaballs?','NO!!'})

h = schemaball;
set(h.l(~isnan(h.l)), 'LineWidth',1.2)
set(h.s, 'MarkerEdgeColor','red','LineWidth',2,'SizeData',100)
set(h.t, 'EdgeColor','white','LineWidth',1)

Цвета по умолчанию:

Чтобы улучшить рендеринг на экране, вы можете запустить MATLAB с помощью экспериментального переключателя -hgVersion 2, который по умолчанию создает анти-алиасную графику (источник: Обновление HG2 | Недокументированный Matlab). Тем не менее, если вы попытаетесь сохранить фигуру, файл будет иметь обычный старый сглаженный рендеринг, поэтому здесь будет изображение с изображением экрана Гюнтера:

Важное обновление:

Теперь вы можете сделать это в Matlab с представлением FileExchange:

http://www.mathworks.com/matlabcentral/fileexchange/48576-circulargraph

Здесь приведен пример использования Matlab:

http://uk.mathworks.com/examples/matlab/3859-circular-graph-examples

Что дает такие красивые сюжеты:

Кстати, Cleve Moler (Математический математик MathWorks) показал пример такого рода сюжетов в своем последнем сообщении в блоге (не так как как в вашем примере, а соединительные линии прямые, а не параболические, но выглядят функционально). К сожалению, он не включил код напрямую, но если вы оставите ему комментарий к сообщению, он обычно очень хочет поделиться вещами.

Что может быть еще лучше для вас, так это то, что он также применяет (и на этот раз) код, чтобы переставлять строки/столбцы массива, чтобы максимизировать пространственную близость узлов с высокой степенью связывания, а не произвольно упорядочивать их вокруг длина окружности. В итоге вы получаете "полумесяц" в виде огибающей соединительных линий, причем толстая часть полумесяца представляет собой наиболее высокосвязные узлы.

К сожалению, однако, я подозреваю, что если вам нужно усилить его код, чтобы получить очень узкие линии с высоким разрешением в ваших примерах, то MATLAB в настоящее время не сглаживает графику еще не совсем.

Недавно я экспериментировал с данными MATLAB и D3 visualization library для похожих графиков - существует несколько связанных типов круговых визуализаций, которые вы можете быть заинтересованным, и многие из них являются интерактивными. Еще один полезный, искушенный и свободно доступный вариант - Circos, который, вероятно, отвечает за большинство более симпатичных версий этих графиков, которые у вас есть видел в популярной прессе.