Команда Python os.system cp копирует пустой файл

Каталог 1: У меня есть несколько файлов txt и один xml файл, который я хочу изменить на каждой итерации в соответствии с содержимым файла txt.

Directory 2: Я хочу скопировать измененный xml файл в этот каталог после каждой итерации.

После выполнения я могу наблюдать измененный xml файл в каталоге 1, который содержит последний контент файла txt, как и ожидалось. Однако каталог 2 содержит пустые файлы с ожидаемыми именами. Может быть, есть какая-то проблема в моей команде cp? Не могли бы вы помочь?

os.system('cp /home/username/xmlFile.xml /home/username/NewFolder/%s.xml' % myString)

Весь скрипт:

#!/usr/bin/python
import os
import re
from shutil import copyfile

arr = os.listdir('/di/rec/to/ry')
newArr = []
for j in arr:
        m = re.search('.*txt', j)
        if m != None:
                newArr.append(m.group(0))
for i in newArr:
        myString = ""
        f = open('/home/username/xmlFile.xml', 'r+')
        i = i[:-4]
        data = f.readlines()
        myString += str(i)
        data[10] = data[10][:36] + i + data[10][64:]
        f.truncate(0)
        f.seek(0)
        f.writelines(data)
        #os.system('cp /home/username/xmlFile.xml /home/username/NewFolder/%s.xml' % myString)
        copyfile('/home/username/xmlFile.xml', '/home/username/NewFolder/%s.xml' % myString)