Есть ли способ перезаписать или пропустить дубликаты записей?
есть ли способ добавить: вставить дублирующее обновление ключа в файл sql, который имеет только вставку?
Посмотрите 12.2.5.1. INSERT... SELECT Синтаксис и 12.2.5. Синтаксис INSERT
Ищите
Укажите IGNORE, чтобы игнорировать строки, которые приведет к нарушениям с дублированием ключа.
попробуйте this:
INSERT ON DUPLICATE KEY UPDATE
Хотя обычно люди забывают поместить поле автоинкремента для идентификатора и, следовательно, ошибку.