Я не могу вызвать пакет rJava
в R 3.0
. Я получил следующее сообщение
Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it
Я получаю ошибку, когда пытаюсь переустановить пакет rJava
. Я предоставил вывод R CMD javareconf
Java interpreter : /usr/bin/java
Java version : 1.7.0_21
Java home path : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre
Java compiler : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar
trying to compile and link a JNI progam
detected JNI cpp flags :
detected JNI linker flags :
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG -fpic -O2 -pipe -g -c conftest.c -o conftest.o
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program
Java library path:
JNI cpp flags :
JNI linker flags :
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.
Я использую Ubuntu 13.04. Я также пробовал apt-get install r-cran-rjava
, который не помогает решить проблему. Что касается jni.h, здесь было какое-то решение . Но не знаете, как я могу использовать это решение здесь.
Я столкнулся с той же проблемой. Моим решением было установить openjdk-7- * через
sudo apt-get install openjdk-7-*
После этого с помощью
sudo R CMD javareconf
и тогда я смог установить rJava в R через install.packages("rJava")
.
Хотя, возможно, это не самое элегантное решение, похоже, решило мои проблемы с работой rJava.
Для тех, кто получает ошибку:
error: unable to load shared object '/some/dir/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so:
cannot open shared object file: No such file or directory
Я решил ошибку, обнаружив библиотеку в системе и связав ее с /usr/lib
:
$sudo updatedb
$locate libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
$sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib/
Установка rJava из дистрибутивных пакетов, предложенная в этом ответе askUbuntu, также работает:
sudo apt-get install r-cran-rjava
ПРИМЕЧАНИЕ. Попробовал систему Debian.
xlsx
или ELT
)
install.packages
я получаю:error: unable to load shared object '/home/cboettig/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.0/rJava/libs/rJava.so':
libjvm.so: cannot open shared object file: No such file or directory
. Есть идеи?