У меня есть Dataframe из 250 столбцов и 4562 строк. Я хочу использовать его в Julialang. Я попытался использовать HDF5 для передачи данных, но он дает ошибку при чтении файла. код:
using HDF5
using DataFrames
data=h5open("Database.h5")
typeof(data)
println("names \n",names(data))
println("\n dump")
println(names(data))
m=data["nse"]
println(names(m))
jj=m["table"]
s=read(jj)
Это ошибка, которую я получил:
HDF5-DIAG: Error detected in HDF5 (1.10.2) thread 0:
#000: H5O.c line 120 in H5Oopen(): unable to open object
major: Object header
minor: Can't open object
#001: H5Oint.c line 553 in H5O_open_name(): unable to open object
major: Object header
minor: Can't open object
#002: H5Oint.c line 589 in H5O_open_by_loc(): unable to determine object class
major: Object header
minor: Can't get value
#003: H5Oint.c line 1575 in H5O_obj_class(): unable to load object header
major: Object header
minor: Unable to protect metadata
#004: H5Oint.c line 889 in H5O_protect(): unable to load object header
major: Object header
minor: Unable to protect metadata
#005: H5AC.c line 1763 in H5AC_protect(): H5C_protect() failed
major: Object cache
minor: Unable to protect metadata
#006: H5C.c line 2565 in H5C_protect(): can't load entry
major: Object cache
minor: Unable to load metadata into cache
#007: H5C.c line 6733 in H5C_load_entry(): invalid len with respect to EOA
major: Object cache
minor: Bad value
#008: H5C.c line 6657 in H5C__verify_len_eoa(): len not positive after adjustment for EOA
major: Object cache
minor: Bad value
String["_i_table", "table"]
Любая помощь очень ценится !!
Для этого я всегда использую формат пера.
Например, в python
import feather
feather.write_dataframe(df, "path/to/file.feather")
а затем в Джулии
using DataFrames, Feather
df = Feather.read("path/to/file.feather")
Вы можете загрузить/сохранить также из R.