Получить несколько строк в MySQL одного запроса в PHP с другим идентификатором

вы неправильно использовали $row, объявляете переменную массива вне цикла, как

    $json_response = array();
    for($j=0;$j<count($id);$j++) {
        $res=mysql_query("SELECT * FROM mutable WHERE id='$id[$j]'")
        while($row=mysql_fetch_array($res)) {
            $json_response[]=array("email"=>$row[2],"name"=>$row[3],"address"=>$row[5]);
            echo json_encode($json_response); // not good to echo here
        }
    }
    // echo json_encode($json_response); // ideally echo should be here

Поместите json_encode() вне ваших циклов.

Позвольте модернизировать и усовершенствовать вещи...

* К сожалению, подготовленные заявления, которые используют предложение IN, страдают от свертки. pdo не страдает одинаково.

Код: (непроверенный)

if(isset($_GET['id0'],$_GET['id1'],$_GET['id2'])){
    $params=[$_GET['id0'],$_GET['id1'],$_GET['id2']];  // array of ids (validation/filtering can be done here)
    $count=count($params);  // number of ids
    $csph=implode(',',array_fill(0,$count,'?'));  // comma-separated placeholders
    $query="SELECT * FROM mutable WHERE id IN ($csph)";

    $stmt=$mysqli->prepare($query);  // for security reasons

    array_unshift($params,str_repeat('s',$count));  // prepend the type values string
    $ref=[];  // add references
    foreach($params as $i=>$v){
        $ref[$i]=&$params[$i];  // pass by reference as required/advised by the manual
    }
    call_user_func_array([$stmt,'bind_param'],$ref);    

    $stmt->execute();
    $result = $stmt->get_result();
    while ($row = $result->fetch_array(MYSQLI_NUM))
        $rows=["email"=>$row[2],"name"=>$row[3],"address"=>$row[5]];
    }
    $stmt->close();
    echo json_encode($rows);
}

Три вещи:

1. Всегда, всегда, всегда используются подготовленные операторы и связанные параметры при работе с недоверенным (т. $_GET) вводом. Просто сделай это.

2. Что касается вашей проблемы с JSON, вам нужно только запустить json_encode:

   $results = [];
   for($j=0;$j<count($id);$j++) {
       ...
       while($row=mysql_fetch_array($res)) {
           results[] = ...
       }
   }
   json_encode( $results );
   

3. Используйте один оператор SQL, поскольку у вас есть известное количество идентификаторов для сбора:

   $dbh = new PDO($dsn, $user, $password);
   $sql = "SELECT * FROM mutable WHERE id IN (?, ?, ?)";
   $sth = $dbh->prepare( $sql );
   foreach ( $sth->execute( [$_GET['id0'], $_GET['id1'], $_GET['id2']] ) as $row ) {
       ...
   

   Это более эффективно, чем многократные поездки в базу данных. Для этого надуманного случая это, вероятно, не имеет значения, но в будущем хорошие привычки будут служить вам в долгосрочной перспективе.