В следующем простом примере я cudaMalloc3D
память на устройстве с помощью cudaMalloc3D
и увеличиваю каждый cudaMalloc3D
своих трехмерных данных на один, который отлично работает, если я использую симметричные трехмерные тома.
Код хоста выглядит следующим образом:
int main(void)
{
typedef float PixelType;
// Set up test data
dim3 image_dimensions = dim3(32, 32, 32);
size_t num_elements = image_dimensions.x * image_dimensions.y * image_dimensions.z;
PixelType *image_data = new float[num_elements];
for(int i = 0; i < num_elements; ++i)
{
image_data[i] = float(i);
}
// Allocate 3D memory on the device
cudaExtent volumeSizeBytes = make_cudaExtent(sizeof(PixelType) * image_dimensions.x, image_dimensions.y, image_dimensions.z);
cudaPitchedPtr devicePitchedPointer;
cudaMalloc3D(&devicePitchedPointer, volumeSizeBytes);
cudaMemset3D(devicePitchedPointer, 1.0f, volumeSizeBytes);
// Copy image data from the host to the device
cudaMemcpy3DParms copy_params_host_to_device = {0};
copy_params_host_to_device.srcPtr = make_cudaPitchedPtr((void *)image_data, sizeof(PixelType) * image_dimensions.x, image_dimensions.y, image_dimensions.z);
copy_params_host_to_device.dstPtr = devicePitchedPointer;
copy_params_host_to_device.extent = volumeSizeBytes;
copy_params_host_to_device.kind = cudaMemcpyHostToDevice;
cudaMemcpy3D(©_params_host_to_device);
// Kernel Launch Configuration
dim3 threads_per_block = dim3(8, 8, 8);
dim3 blocks_per_grid = dim3((image_dimensions.x + threads_per_block.x - 1) / threads_per_block.x, (image_dimensions.y + threads_per_block.y - 1) / threads_per_block.y, (image_dimensions.z + threads_per_block.z - 1) / threads_per_block.z);
extract_patches_from_image_data<<<blocks_per_grid, threads_per_block>>>(devicePitchedPointer, image_dimensions);
cudaDeviceSynchronize();
// Copy image data back from the device to the host
cudaMemcpy3DParms copy_params_device_to_host = {0};
copy_params_device_to_host.srcPtr = devicePitchedPointer;
copy_params_device_to_host.dstPtr = make_cudaPitchedPtr((void *)image_data, sizeof(PixelType) * image_dimensions.x, image_dimensions.y, image_dimensions.z);
copy_params_device_to_host.extent = volumeSizeBytes;
copy_params_device_to_host.kind = cudaMemcpyDeviceToHost;
cudaMemcpy3D(©_params_device_to_host);
// Check image data
for(int i = 0; i < num_elements; ++i)
{
std::cout << "Element: " << i << " - " << image_data[i] << std::endl;
}
// Free Memory
cudaFree(devicePitchedPointer.ptr);
delete [] image_data;
}
Соответствующее ядро для приращения всех значений:
__global__ void extract_patches_from_image_data(cudaPitchedPtr devicePitchedPointer, dim3 image_dimensions)
{
// Index Calculation
int x = threadIdx.x + blockDim.x * blockIdx.x;
int y = threadIdx.y + blockDim.y * blockIdx.y;
int z = threadIdx.z + blockDim.z * blockIdx.z;
// Get attributes from device pitched pointer
char *devicePointer = (char *)devicePitchedPointer.ptr;
size_t pitch = devicePitchedPointer.pitch;
size_t slicePitch = pitch * image_dimensions.y;
// Loop over image data
if(z < image_dimensions.z)
{
char *current_slice_index = devicePointer + z * slicePitch;
if(y < image_dimensions.y)
{
// Get data array containing all elements from the current row
PixelType *current_row = (PixelType *)(current_slice_index + y * pitch);
if(x < image_dimensions.x)
{
current_row[x] = current_row[x] + 1.0f;
// Get values of all all neighbors
}
}
}
}
До тех пор, как я держу image_dimensions
симметричным, например, (32, 32, 32), все работает отлично. Когда я пытаюсь использовать (32, 32, 33), он работает нормально до voxel 33759, следующие значения остаются неизменными. Теперь мой вопрос заключается в том, как я должен адаптировать свой код, чтобы использовать несимметричные данные.
float
в cudaMemset3D
. Если это ваше намерение установить каждое количество с плавающей запятой на это значение, это не сработает. cudaMemset3D работает как функция memset
хозяина. Он принимает значение unsigned char
и устанавливает значения unsigned char
. Вы не можете использовать этот метод для правильной инициализации значения float
до 1.0f. Но это также не суть вашей проблемы.make_cudaPitchedPtr
правильно. Ознакомьтесь с документацией. Ваши последние два параметра должны быть соответственно размерами x
и y
, а не y
и z
. В вашем коде есть два примера. Я смог заставить ваш код работать корректно с модификацией двух применений make_cudaPitchedPtr